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下载iTOL官网示例文件解压后得到示例文件,根据想做的图找到示例文件进行制作注释文件Phl002TREE_COLORS #修改类型;进化树注释文件通过下载iTOL官网上提供的进化树不同数据集注释模板网址cgi#annot,模板下载参考下图操。

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进行1000次bootstrapping抽样 threads给定线程 运行后结果如下图所示,其中bestTree就是我们要的树文件,导入树可视化工具即可我比较常用MEGA和 iTOL ,下次再写一下如何美化进化树吧做进化分析的工友们可能都有。

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上方脚本复制到终端里运行,亲测有效,生成一个quotstyle3quot文件夹方案4 将整数转化成因子生成注释文件 Rscript table2itolR a c factor D plan4 i OTUID l Genus t %s w 0 annotationtxt 方案5。

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